Am 13. Mai 1981 schoss Mehmet Ali Agca auf den Hl. Vater Papst Johannes Paul II. auf dem Petersplatz in Rom. Im selben Augenblick hatte sich der Papst herabgebeugt, um die Fatima-Medaille eines kleinen Mädchens zu betrachten. So konnten die tödlichen Geschosse nicht in seinen Kopf und seine Brust eindringen.
Ein Jahr später pilgerte der Papst zum Heiligtum in Fatima und übergab die Kugel des Mörders an die Muttergottes als Dank dafür, dass sie sein Leben gerettet hatte.
Am 13. Mai 2000 sprach der Papst Francisco und Jacinta Marto selig, zwei der drei Kinder, die mit Lúcia, die damals noch lebte, die Jungfrau Maria während der Erscheinungen 1917 gesehen hatten. Im gleichen Jahr veröffentlichte er das „Dritte Geheimnis“ von Fatima: die Vision von Schwester Lúcia vom Martyrium eines „weißgekleideten Bischofs“, umgeben von anderen Katholiken.
2002 fügte Papst Johannes Paul II. dem liturgischen Kalender das Fest Unserer Lieben Frau in Fatima als nicht gebotenen Gedenktag am 13. Mai hinzu.