« Si je veux qu'il demeure jusqu'à ce que je vienne, que t'importe ? » a prophétisé le Christ en réponse à la question de Pierre : « Et lui Seigneur ? » à propos de Jean. De fait, Jean est demeuré très âgé, au point d'être pendant longtemps le dernier Apôtre encore en vie. L'Evangile rapporte en le corrigeant « le bruit qui s'était répandu parmi les disciples qu'il ne mourrait pas ». Jean est finalement mort presque centenaire à Ephèse, sous le règne de Trajan, d'après Saint Irénée, après l'an 104.Après le repos et l'ensevelissement merveilleux du Saint Apôtre Jean le Théologien à Ephèse (qui est fêté chaque année le 26 septembre), son tombeau fut trouvé vide, et il devint une source de miracles Le 8 mai, l'Eglise d'Orient célèbre la Synaxe en l'honneur de la cendre ou Sainte "Manne" que produisait le tombeau du saint et illustre. En effet chaque 8 mai le tombeau était soudainement recouvert d'une sorte de cendre, que les Chrétiens du lieu appelèrent la "Manne", laquelle avait la vertu de guérir les maladies de l'âme et du corps de ceux qui s'en oignaient avec foi. Ce miracle procura donc l'occasion à l'Eglise de célébrer solennellement une seconde fois, tous les ans, le Disciple Bien-aimé du Seigneur, fils chéri de la Mère de Dieu. Son tombeau est encore vénéré, aujourd'hui, sur place dans l'immense Basilique Saint Jean qui lui a été consacrée. Saint Jean apparut ensuite bien des fois dans l'histoire de l'Eglise : dès le III° siècle, à Grégoire le Thaumaturge, à Saint André le fou dans l'Eglise des Blachernes à Constantinople, à Sainte Catherine de Sienne, à Saint Jean de Dieu, au Pape Célestin V (1215-1296), à Ferdinand du Portugal (1402-1443), à un jeune cistercien admis par Saint Bernard, à Flodoard de Reims (v.893-966), à Gherardesca de Pise (+1269), à Marie Amice Picard le 19 mai 1634, à Heroldsbach (1949-1952, à Knock en Irlande le 21 août 1879), ou à Séraphin de Sarov. Nous devons noter que ces apparitions étaient toujours en compagnie de la Vierge Marie, sa mère, comme pour insister sur son lien unique avec la Mère de Dieu. La Révélation de Dieu est scellée par les écrits johanniques - Révélation définitivement close à la mort du grand Saint Jean.